Thời kỳ Mê-đi-Ba Tư (537-331 TCN)
Sự thống trị của người Medo-Ba Tư ở Jerusalem bắt đầu khi Cyrus đánh bại người Babylon vào năm 539 trước Công nguyên. Hầu như ngay lập tức Cyrus đã đảo ngược chính sách tàn bạo của người Babylon vốn đã di dời những dân tộc bị chinh phục khỏi quê hương của tổ tiên họ. Cyrus tin rằng những dân tộc bị chinh phục của ông sẽ dễ quản lý hơn và thu được nhiều lợi nhuận hơn nếu họ vui vẻ trở về các đền thờ và thành phố của mình để phát triển thịnh vượng ở quê hương.
Bàn tay quan phòng của Đức Chúa Trời đã được nhìn thấy trong lời tuyên bố của Si-ru rằng tất cả những người bị giam cầm đều có thể trở về nhà của họ. Điều này có nghĩa là người Do Thái có thể trở về quê hương của họ. Zerubbabel, nhà lãnh đạo chính trị, và Joshua, thầy tế lễ thượng phẩm, dẫn đầu nhóm tù nhân đầu tiên trở về Jerusalem (Ezra 2:2), mang theo đồ đạc trong đền thờ (Ezra 5:14–15; 520 TCN). Ngay lập tức họ lập một bàn thờ để dâng của lễ thiêu, giữ Lễ Lều Tạm, và tiến hành các bước xây dựng lại đền thờ (E-xơ-ra 3:2–8). Ngôi đền được hoàn thành vào năm 516 trước Công nguyên với sự khuyến khích và động viên của các nhà tiên tri A-ghê và Xa-cha-ri.
Vào năm 458 trước Công nguyên, Ezra dẫn đầu một nhóm tù nhân từ Ba Tư trở về Jerusalem, những người đã tiến hành cải cách đạo đức trong người dân. Nehemiah được bổ nhiệm làm thống đốc Jerusalem và Judea vào năm 445 trước Công nguyên và nhận được sắc lệnh từ Vua Artaxerxes I để xây dựng lại các bức tường. Việc này được hoàn thành trong 52 ngày (Nê-hê-mi 6:15), và sự dâng hiến diễn ra sau đó (Nê-hê-mi 12:27). Ezra dẫn đầu dân chúng trong một buổi họp long trọng kiêng ăn, xưng tội và tái cam kết với giao ước của đất nước với Đức Chúa Trời. Luật pháp Cựu Ước được coi là trọng tâm trong đời sống của người Do Thái. Việc thờ phượng ngày Sabát bị nhấn mạnh, những người không phải là người Israel bị trục xuất và chức tư tế được quản lý chặt chẽ.